„Okno wodne”, czyli fala świetlna o długości od 2,3 nm do 4,4 nm, daje silny kontrast optyczny dla próbek biologicznych. Mikroskop, który wykorzystuje fotony o tak skróconej długości fali, ma rozdzielczość nawet kilkadziesiąt razy lepszą niż w mikroskopach pracujących ze światłem widzialnym.